معصومه ملک محمدی ازجمله کسانی است که نامش در لیست سران سازمان تحت پیگرد قضائی درعراق ثبت شده است…شرکت وی بعنوان فرمانده ارشد در کشتار کردها در خانقین، منطقه مروارید در سال ۱۹۹۱ نام برد. خانم ملک محمدی یکی از سران و شکنجه گران زندان های ۱۹۹۵ فرقه در قرارگاه اشرف نیز بود که بسیاری از اعضای ناراضی را بازجوئی و شکنجه کرده و یکی از قضات دادگاه هایی!! بود.
طبق آخرین خبرهای رسیده از عراق، قرار بوده که ۱۰۰ نفر از کمپ موقت لیبرتی به کشور البانی فرستاده شوند. سازمان مجاهدین از فرصت می خواسته استفاده کند و خانم معصومه ملک محمدی را که از مسئولین رده بالای شورای رهبری است، برای بار دوم به این طریق از عراق خارج کند. ولی دولت عراق مانع خروج خانم معصومه ملک محمدی از عراق شده، اظهار داشته اند که وی شاکی خصوصی دارد و به دادگاه احضار شده است. بدین وسیله سازمان مجاهدین مانع خروج بقیه نفرات شده است.
همانطور که در نامه ای که به تاریخ ۲۹ سپتامبر به امضاء ۴۴ نفر از اعضاء سابق و منتقدان سازمان مجاهدین خلق ایران به وزیر کشور البانی آمده است *: (خانم معصومه ملک محمدی یکی از بالاترین فرماندهان خودرا از کمپ لیبرتی جهت تقویت تشکیلات به البانی بفرستند نامبرده یکی از چهره های مهم سازمان مجاهدین خلق می باشد. مهمترین هدف سازمان مجاهدین تلاش برای دورنمودن وی از پیگرد قانونی، قوه قضائی عراق می باشد. معصومه ملک محمدی ازجمله کسانی است که نامش در لیست سران سازمان تحت پیگرد قضائی درعراق ثبت شده است.از جمله مسئولیت های ایشان در عراق بعنوان مسئول روابط خارجی سازمان درعراق، اجرای ملاقات ها و معاملاتی انجام شده با دولت صدام حسین بوده است.
اجرای پروژهای دخالت در امور عراق در ۱۰ سال اخیر، تلاش برای ایجاد تفرقه وبر هم زدن اوضاع داخلی عراق، ایجاد انجمن ها واحزاب بنام عراقی ها و حمایت از گروه های خاص تروریستی در عراق، حمایت از گروه تروریستی طارق الهاشمی (معاون سابق ریئس جمهورعراق که الان فراری است) از جمله اقدامات خانم معصومه ملک محمدی در کشور عراق بوده است. ازاقدامات تروریستی ایشان می شود از شرکت وی بعنوان فرمانده ارشد در کشتار کردها در خانقین، منطقه مروارید در سال ۱۹۹۱ نام برد. خانم ملک محمدی یکی از سران و شکنجه گران زندان های ۱۹۹۵ فرقه در قرارگاه اشرف نیز بود که بسیاری از اعضای ناراضی را بازجوئی و شکنجه کرده و یکی از قضات دادگاه هایی!! بود که مسعود رجوی برعلیه ناراضیان برگزار می کرد. نام این خانم در کنار یکی از مسئولین مرگهای مشکوک در درون سازمان مجاهدین برده می شود. خانم ملک محمدی در سال های ۱۹۹۵ و۱۹۹۶ نیز در هنگام اقامت در پاکستان بدلیل اقدامات غیرقانونی تحت پیگرد قضائی دولت آنجا بودکه با اسم و پاسپورت جعلی عراقی از پاکستان به عراق گریخت) نکته قابل توجه این است که بعد از نوشتن نامه مذبور به وزیر کشور البانی سازمان مجاهدین به نام یکی از مواجب بگیران خود (عبدالعلی معصومی)** سوز و گداز خود را از این نامه نوشتن مخفی نکرد و در ۳ صفحه فحش و ناسزا چیز دیگری برای بیان کردن نداشت. این برخورد نشان از واقعیت های است که بیان شده است.
وقتی که خانم معصومه ملک محمدی به خاطر مسله پیگرد قضائی نمی تواند از عراق خارج شود. سازمان مجاهدین خلق از حرکت کردن ۱۰۰ نفر از کمپ موقت لیبرتی به کشور البانی ممانعت به عمل می آورد. با این عمل کرد خود بار دیگر به همگان ثابت کرد که هیچ ارزشی برای جان اعضاء خود قائل نیست و تنها سران اصلی سازمان برای مسعود رجوی اهمیت دارد.این موضوعی است که بارها اعضاء جدا شده از سازمان آن را بیان کرده اند.