سرانجام گشتاپوی فرقه مجاهدین نسبت به جدایی و انتقادات آقای محمد علی اصفهانی واکنش نشان داد و به مانند فرهنگ حاکم بر فرقه ها وی را مورد دشنام و تهدید قرار داد و وی را "جوجه بسیجی" و… نامید. بر همین اساس محمد علی جابرزاده از سوی رهبری فرقه برای ترور شخصیتی آقای محمد علی اصفهانی در سایت های متعلق به فرقه مجاهدین وارد عمل شد. سایت ایران قلم یادآوری می کند بخش جاسوسی و سرکوب مجاهدین از دو بخش نرم افزاری و همچنین عملیاتی بهره می برد که مسئولیت بخش نظریه پردازی و جنگ روانی با منتقدین فرقه با محمد علی جابرزاده با نام مستعار قاسم و مسئولیت بخش عملیاتی با محمد ثانی با نام مستعار نادر می باشد.
از توهین نامه آقای جابرزاده و همچنین نوشته های آقای محمد علی اصفهانی که سایت ایران قلم در روزها و هفته های گذشته چندین مورد آن را منتشر کرده، چنین بر می آید که یکی از دلایل اصلی جدایی آقای اصفهانی از شورای ملی مقاومت علاوه بر خودکامگی های حاکم بر رهبری مجاهدین، انتقاد به روش های خشونت طلبانه و رویکرد وی به مبارزات "پرهیز از خشونت" و مخالفت جدی وی با "جنگ" بوده است که اتفاقا از همین زاویه رهبری فرقه مجاهدین را بشدت عصبانی کرد. آقای محمد علی اصفهانی در یکی از مطالبی که با عنوان " زمینه سازی قتل عام بچه های پادگان اشرف " به قلم سعید منادی در سایت خود منتشر کرده، چنین آمده بود:
"رهبران مجاهدین از یک سو بزرگترین دستمایه‌شان برای معامله با دلالان لابیهای اسرائیل و جنگ‌طلبان آمریکایی در کریدورهای دیپلوماتیک، جانهای پاک بچه‌های مردم در پادگان اشرف است، و از طرف دیگر می دانند که خروج این بچه‌ها از آن محیط بسته و ورودشان به یک فضای باز یا کمتر بسته، باعث گشوده شدن چشم و گوش آنان به واقعیتها و انتخاب آزادانه راهی خواهد شد که قطعاً از نفی این رهبران می‌گذرد»
همچنین محمد علی اصفهانی در مطلبی با عنوان " شاملو شاعر انسان گرا و نه سیاسی " که با مقدمه ای در سایت ایران قلم نیز منتشر شد، عمق و محتوی اندیشه مجاهدین را در ارتباط با هنر به نقد کشید و نوشت:
" در روز اعلام خبر مرگ شاملو، در تابستان
