یکی از اتهامات و در واقع جنایات ثابت شده سازمان مجاهدین خلق، شکنجه و به قتل رساندن افراد عادی کوچه و بازار فقط به جرم داشتن ظاهر مذهبی است.
در جلسه 24 دادگاه رسیدگی به اتهامات سران مجاهدین خلق، وکیل شکات به یکی از جنایات دهشتناک سازمان در عملیات های موسوم به مهندسی اشاره کرد.
امیر ملایی وکیل شکات در این باره گفت: بعد از ضربه ۱۲ اردیبهشت، خط شکنجه داده شد. در تحلیل سازمان نسبت به شکنجه گفته میشد که ما ضربه نظامی زیادی به رژیم زدهایم، اما کار اطلاعاتی نکردیم، موفقیت کار اطلاعاتی بسیار بالاست، از طرفی ما هر شیوهای اعم از ترور و به آتش کشیدن منازل و ترور را انجام دادیم ولی نتیجه خاصی نداشت و باید به کار اطلاعاتی روی بیاوریم و با شکنجه افرادی که عضو شبکههای اطلاعاتی رژیم هستند میتوانیم به راحتی، خطمان را جلو ببریم و حیات و موجودیت سازمان تنها و تنها با ادامه شکنجه امکانپذیر است.
وی گفت: این گروهک علاوه بر انجام عملیات تروریستی علیه مسئولان جمهوری اسلامی ایران ترور شهروندان عادی زنان و کودکان را به عنوان یکی از اهداف اصلی خود و به منظور ایجاد رعب و وحشت در میان مردم در دستور کار خود قرار داده است. در این راستا این گروهک شکنجه و ترور شهروندان عادی همچون کارگر، کفاش، معلم ورهگذر عادی را در فهرست اقدامات خود دارد. این گروهک توجیه و استدلال خود در انجام این اقدامات تروریستی که به فجیعترین شکل ممکن از قبیل سوزاندن و پوست کندن انجام میشد را صرفاً داشتن ظاهر مذهبی این افراد میداند.
امیر ملایی وکیل شکات در ادامه نحوه ترور و شکنجه عباس عفت روش را با استناد به اعترافات اعضای مجاهدین خلق روایت کرد:
حسب اظهار و اقرار متهمان دستگیر شده اعضای سازمان مجاهدین موسوم به گروهک تروریستی منافقین، مرکزیت سازمان به دنبال ضربات پی در پی به بدنه تشکیلاتی سازمان در سال ۶۱ که طی آن خانههای تیمی زیادی از سازمان شناسایی و بسیاری از اعضای سازمان دستگیر شدند، به منظور شناسایی عوامل موثر در ضربه فوق، اقدام به ربودن آقای عفت روش که به ادعای اعضای سازمان خود و همسرش دارای ظاهر حزبالهی بوده است، میکنند.
در این راستا در تاریخ ۱۷ مرداد ۶۱ ساعت ۱۰ شب به دستور مرکزیت سازمان مبنی بر ربودن عباس عفت روش که کفاش بودند، تیم عملیات ویژه سازمان در ساعت فوق به در منزل وی مراجعه کرده و به دلیل عدم حضور او به محل کارش در شمیران نو رفته و با استفاده از لباس کمیته و با ارائه اسناد جعلی، وی را با خود میبرند و وقتی او را سوار خودرو کرده دستها و چشمهای او را بسته و او را به خانهای تیمی منتقل و او را تحت شدیدترین شکنجهها قرار داده تا اطلاعات مورد نظرشان را بگیرند و زمانی که به نتیجه نمیرسند، نامبرده را پس از شکنجه بسیار با تزریق آمپول سیانور به شهادت رسانده و دستها و پاهای او را بسته و وی را در صندوق عقب خودرویی قرار داده و به محلی از پیش تعیین شده میبرند و در آنجا جسد وی را دفن میکنند.
مستنداتی که درباره شکنجههای شهید عفتروش وجود دارد، اقرار و اعتراف متهم مهران اصدقی از مسئولان بخش مهندسی و یا همان شکنجه سازمان و فرمانده تیمهای تروریستی در تهران درباره شکنجه و نحوه شهادت این شهید و ذکر اسامی عوامل دخیل در جنایت مذکور است.
مهران اصدقی در اعترافات خود گفته است، حوالی عصر مصطفی معدن پیشه در اثر تکان خوردن محسن میرجلیلی در داخل حمام تیری شلیک کرد و مجبور به تخلیه خانه شدیم که تصمیم به از بین بردن پاسداران و کفاش گرفتیم. آنها را روی صندلی بستیم، چشمهایشان را بستیم و با همان میلههای سربی آنها را بی هوش کردیم و سپس آمپول سیانور به بدنشان تزریق کردیم که بعد از تزریق سیانور صدای خرخر از گلوی آنها خارج شد. ما در حالی که آنها هنوز زنده بودند، بدن آنها را طوری با طناب بستیم که داخل صندوق عقب خودرو جا شوند. این موارد صحبتهای مهران اصدقی مسئول نظامی تیمهای تروریستی در تهران است که آن را در برگه بازجویی زمانی که دستگیر شده بود، نوشته است.
منافقین کفاش را صرفاً به دلیل اینکه چهره مذهبی داشته دستگیر کردهاند و او را نمیشناختند و فقط میدانستند که او کفاش است. بحث مهندسی شکنجههای این گروهک بسیار مشهور و معروف است و اسم آن را عملیات مهندسی گذاشته بودند.